Kempen Perancis menentang Mesir bermula pada tahun 1798 di bawah pimpinan Napoleon Bonaparte, tetapi mereka tidak dapat mengawal seluruh negara, kerana Mesir Hulu kekal di bawah kawalan Mamluk.
Walaupun kempen Perancis berlangsung tidak lebih dari tiga tahun, dengan Perancis meninggalkan Mesir pada tahun 1801 akibat penentangan Mesir yang sengit, ia mempunyai kesan yang besar terhadap sejarah Mesir moden, kerana ia menarik perhatian Eropah kepada kepentingan lokasi Mesir, yang meningkatkan minat mereka untuk merebutnya, terutamanya Britain.
Pada tahun 1805, Muhammad Ali menjadi pemerintah Mesir di bawah Khilafah Uthmaniyyah. Seorang tentera dalam tentera Uthmaniyyah yang berasal dari Albania, Muhammad Ali adalah seorang pemimpin yang bijak yang secara beransur-ansur menghapuskan semua musuhnya sehingga menguasai negara sepenuhnya. Dia menggabungkan Hejaz ke Mesir pada tahun 1819, dan kemudian Sudan dari 1820 hingga 1822.
Kemudian dia hampir menghapuskan Khilafah Uthmaniyyah, tetapi terpaksa berundur di bawah tekanan Eropah. Di Mesir, Muhammad Ali mengembangkan penanaman dan pembuatan kapas. Beliau menubuhkan projek perindustrian, menghantar misi pendidikan ke luar negara, dan melantik pakar asing untuk melatih tentera Mesir. Beliau juga melaksanakan projek-projek lain yang bertujuan untuk membuka negara kepada dunia, terutamanya selepas pengasingan lama Mesir di bawah Uthmaniyyah dan Mamluk pada tahun 1831.
Muhammad Ali dan anaknya Ibrahim kemudian mengetuai kempen ke arah Syria, yang membawa kepada pertembungan dengan Sultan Uthmaniyyah. Tentera Mesir mengalahkan tentera Turki pada tahun 1833. Mereka hampir memasuki semula ibu kota Turki, Istanbul, apabila Rusia, Britain, dan Perancis melindungi Sultan, memaksa beliau berundur. Walau bagaimanapun, dia tetap mengawal Syria dan pulau Crete. Muhammad Ali kemudian memberontak terhadap Sultan pada tahun 1839, dan mereka berhadapan dengan baginda buat kali ketiga, memaksa baginda berundur.
Muhammad Ali meninggal dunia pada tahun 1849 Masihi setelah memastikan pemerintahan Mesir akan berpindah kepada anak-anaknya.